Nowe pokolenie otaku wkracza do Genshiken – pod przewodnictwem Ogiue klub staje się azylem dla fujoshi, cosplayerów i... jednego chłopaka w żeńskim przebraniu. Wśród twórczości doujinshi, emocjonalnych rozterek i cosplayów rodzą się przyjaźnie, uczucia i nowe konflikty.